高等研究院设战略发展委员会、学术委员会和院务委员会，并下设三个办公室：

• 行政综合办公室负责运营管理，包括对外宣传、内部管理等。

• 项目管理办公室负责科研项目立项和推进，科研成果发布、国内外学术平台推广、组织高端学术活动。

• 学术办公室负责学术资源拓展和联系、开展学术研究、中英文刊物和月度报告的编辑。